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      2. 產品分類
        CRISPR/Cas9基因敲除敲入
        shRNA/sgRNA載體構建,活性篩選
        siRNA
        miRNA
        mRNA合成、sgRNA合成
        蛋白表達分子細胞實驗/新冠
        病毒包裝
        質粒及載體構建
        精選試劑
        科研儀器
        優勢服務

        宏基因組高通量測序服務

                宏基因組學(Metagenomics)又叫微生物環境基因組學、元基因組學。它通過直接從環境樣品中提取全部微生物的DNA,構建宏基因組文庫,利用基因組學的研究策略研究環境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。實驗通過特定環境中全部微生物的總DNA(也稱宏基因組,metagenomic)進行克隆,并通過構建宏基因組文庫和篩選等手段獲得新的生理活性物質;或者根據rDNA數據庫設計引物,通過系統學分析獲得該環境中微生物的遺傳多樣性和分子生態學信息。
                我們把提取的DNA進行PCR擴增,主要包括16S rDNA測序、18S rDNA測序、ITS測序及功能基因檢測等。采用illumina MiSeq第二代高通量測序平臺測定的16S/18S /ITS某個高變區域的序列,來反應環境樣品在細菌、真菌、古菌分類方面物種之間的差異,對研究海洋、土壤、腸道糞便等環境中的微生物構成有重要的指導作用;同樣,也可通過對某些功能基因片段的測序,挖掘更多的生物學信息。
                根據不同的研究目的和需求,擴增子測序可以細分為如下4個產品:
                16S rDNA測序 : 16S rDNA為編碼原核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列,采用MiSeq測序儀,對16S rDNA某個高變區進行測序,進一步做環境微生物中細菌或古菌多樣性分析。
                18S rDNA測序 : 18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。在結構上分為保守區和高變區,保守區反映生物物種間的親緣關系,高變區反映物種間的差異。
                ITS 測序 : ITS分為兩個區域:ITS1/ITS2,ITS1位于真核生物核糖體 rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位于真核生物核糖體 rDNA序列5.8S和28S之間。對ITS1或者ITS2進行測序,進一步做環境微生物中真菌多樣性分析。
                功能基因檢測 : 根據客戶的研究需求,利用第二代高通量測序技術,依據PCR產物長度大小,采用HiSeq或MiSeq測序儀,對多種功能基因的PCR產物提供測序及分析服務。
         
               16s DNA/18s DNA/ITS數據分析項目  
               16sDNA/18sDNA/ITS測序數據的分析內容包括序列預處理、序列聚類操作分類單元(OTU)、Alpha多樣性分析、賦予物種分類單元、Beta多樣性分析、組間物種分類單元篩選。
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